предложу такой вариант, из тех материалов, что есть у меня под рукой и перое что пришло в голову.
Берем пенополеуретан или плотный поролон с закрытыми порами. Вырезаем из него подобие пробки-заглушки по диаметру отверстий. Чтобы не проваливалась внутрь, если не взелет плотно, то предварительно затолкать внутрь скомканый поролон, тонкий понополеуретан и т.п. Потом "заткнуть" нашими пробками. После для герметизации залить по краям и сверху силиконовым герметиком. Для фиксации можно и термоклеем залить по краю... а потом опять же силиконом залить и оставить на день -два. Вытащить эти "пробки" потом можно будет без особых проблем.
Если будете делать так, то во-первых обезжирте место, где будете силиконить и не допускайте протечки силикона внутрь кулера.
И еще вопросы, а нужно ли его закрывать? Ну попадет кислота внутрь.. промоете помотом его тщательно. Но лучше конечно герметизировать. Не разъест ли кислота кулер до дыр? Рекомендую после процедуры это проверить..