А зачем что-либо конвертировать?
Все последние версии Nero Burning ROM пишут *.flac напрямую на CD. Если и не пишут, то есть куча плагинов.
Например, здесь: http://www.bitburners.com/category/software/audio/nero-audio-plugins/
Конвертирование без потерь - только в *.wav любым аудио-конвертором.
P777HX
CUE Tools: strongly recommended! Конвертирует во что хочешь (без потерь - lossless, с потерями - МР3), разбивает цельные рипы во flac подорожечно (если есть файл cue + автоматически называет треки).